桃钙调磷酸酶B类似蛋白基因家族鉴定与分析

• 作者: 任飞 吴婷 张杰伟 谢华 魏建华
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 钙调磷酸酶B类似蛋白 桃 基因家族 进化分析 序列特征
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 511-516
• 页数: 6页
• 分类号: S662.1
• 字数: 3247字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2017.3.005

摘要

为了研究桃钙调磷酸酶B类似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何发挥作用.利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CBL家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析.结果表明,桃基因组中含有8个CBL家族基因,分布于桃的5条染色体上.MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CBL蛋白均含有4个保守的EF结构域.进化树分析表明CBLs可分为4个亚家族.TMHMM 2.0Server分析显示仅PpCBL1含有1个跨膜区.PlantsPFeatureScan分析显示PpCBL2、3和5均含有1个N-豆蔻酰化位点.NetPhos 2.0 Server结果显示PpCBLs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点.以上结果将为今后揭示桃CBL的功能提供重要的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏建华	北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室	30	439	11.0	20.0
2	吴婷		5	50	4.0	5.0
3	谢华	北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室	13	91	7.0	9.0
4	任飞	北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室	14	25	3.0	4.0
5	张杰伟	北京市农林科学院农业基因资源与生物技术北京市重点实验室	8	8	1.0	2.0