一个可区分银鲫F系和A+系BAC序列的特征、染色体定位和SCAR标记筛选

• 作者: 周莉 李志 李熙银 桂建芳 汪洋 洪玮
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 多倍体银鲫 转座子 Tcl-like BAC SCAR标记
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 页码范围: 1169-1176
• 页数: 8页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 4661字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2017.145

摘要

为了揭示F系和A+系的遗传差异以及解析F系的遗传特征,研究基于前期基因组Survey分析发现一个特异于银鲫F系大小为782 bp片段的基础,首先采用混合池筛选方法从银鲫F系BAC文库中筛选出一个包含该特异片段的BAC克隆(F782-BAC).鸟枪法测序结果表明,F782-BAC序列全长大小为172625 bp,富含转座子序列,包含1个具备完整结构的Tc l-like转座子,以及不具备完整结构的transposase-like、PIF/Harbinger、target-primed reversed transcription(TPRT)和transpon X-element等6个转座子.用地高辛标记F782-BAC质粒得到的DNA探针进行了银鲫F和A+系有丝分裂中期相的染色体荧光原位杂交,结果表明不论是在F系还是A+系的有丝分裂中期相中,3个阳性荧光信号皆清晰地定位于3条大小相同的近端着丝粒染色体短臂的近着丝粒位置.进一步开展了银鲫A+系相应同源的F782-BAC序列的差异鉴定和序列分析,揭示A+系缺失了大小为3395 bp的一段序列,且特异于银鲫F系大小为782 bp的片段正好位于其中,并由此筛选出可作为区分银鲫F系和A+系的SCAR标记.研究为银鲫的多倍化起源提供了进一步的染色体定位证据,鉴定的SCAR标记可为银鲫分子标记辅助育种提供新的遗传标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周莉	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	147	3705	32.0	57.0
2	汪洋	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	112	1200	19.0	30.0
3	李志	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	18	104	5.0	10.0
4	洪玮	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
8	李熙银	中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
9	桂建芳		1	1	1.0	1.0