适用于转录组测序的人参根总RNA提取方法的筛选

• 作者: 王文娟 王颖芳 陈艳琳
• 来源期刊: 广东药学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 长白山人参 总RNA 多糖多酚 RT-PCR RNA-Seq
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 页码范围: 18-22
• 页数: 5页
• 分类号: R282.2
• 字数: 3752字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16809/j.cnki.2096-3653.2016111701

摘要

目的 筛选适用于转录组测序的人参根组织总RNA提取方法.方法 以15年生长白山人参为研究对象,比较RNAiso Plus法、Trizol法、改良CTAB法、植物总RNA提取试剂盒、多糖多酚总RNA提取试剂盒(RNA prep Pure Plant Kit)提取人参根组织总RNA,利用琼脂糖凝胶电泳、Aligent 2100 Bioanalyzer对5种方法提取的总RNA进行质量检测.结果 Trizol法和RNAiso Plus法均能提取到总RNA,1%琼脂糖凝胶电泳显示28S、18S条带清晰稳定,D(γ)260 nm/D(γ)280 nm和D(γ)260 nm/D(γ)230 nm值均在2.0左右.Trizol试剂法提取总RNA的28S条带亮度明显高于18S,所得RNA浓度达485.66 ng/μL,经Aligent 2100 Bioanalyzer检测,28S条带亮度是18S的2倍.RNA prep Pure Plant Kit试剂盒及植物总RNA提取试剂盒提取RNA的条带模糊、弥散,RNA降解严重.改良CTAB法无法完成人参根组织总RNA的提取.结论 Trizol试剂法提取的人参根组织总RNA浓度、纯度及完整性与其他方法相比效果最佳,能满足转录组测序的要求,是人参根组织总RNA提取的首选方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王颖芳	广东药科大学中药学院	14	35	3.0	5.0
2	陈艳琳	广东药科大学中药学院	5	18	2.0	4.0
3	王文娟	广东药科大学中药学院	4	7	1.0	2.0