盐胁迫对南方泡桐基因表达的影响

• 作者: 曹亚兵 李冰冰 范国强 董焱鹏 赵振利 邓敏捷
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 南方泡桐 盐胁迫 差异表达基因 转录组
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 471-480,486
• 页数: 11页
• 分类号: S792.43
• 字数: 6936字
• 语种: 中文

摘要

为阐明泡桐多倍体的耐盐分子机制,以南方泡桐二倍体及对应的四倍体为试验材料,以白花泡桐基因组为参考序列,利用RNA-Seq测序技术,研究了盐处理前后南方泡桐四倍体和对应二倍体的基因表达变化.通过比对分析,共鉴定出与盐胁迫相关的差异表达基因2 940个.对这些差异基因进行GO功能分类,结果显示差异基因共参与了39个分类,集中在细胞、结合、催化等分类功能区的数量最多.KEGG代谢通路分析发现,这些差异表达基因主要参与了Plant hormone signal transduction,Carbon metabolism,Biosynthesis of amino acid等,其中编码MYB、WRKY、bZIP、ATPase等的基因差异表达显著.表明这些基因可能是潜在的盐胁迫响应基因.采用qRT-PCR技术验证了随机挑选的9个差异表达基因,结果与转录组测序数据趋势一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范国强	河南农业大学泡桐研究所	106	1402	22.0	31.0
2	赵振利	河南农业大学泡桐研究所	59	389	11.0	17.0
3	邓敏捷	河南农业大学泡桐研究所	24	173	8.0	12.0
4	董焱鹏	河南农业大学泡桐研究所	14	105	6.0	10.0
5	李冰冰	河南农业大学泡桐研究所	10	11	2.0	3.0
6	曹亚兵	河南农业大学泡桐研究所	9	21	3.0	4.0