干旱胁迫对豫杂一号泡桐基因表达谱的影响

• 作者: 张雯宇 曹喜兵 范国强 谢博洋
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 豫杂一号泡桐 干旱胁迫 差异表达基因 转录组
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 林业科学
• 页码范围: 876-883
• 页数: 8页
• 分类号: S792.43
• 字数: 4419字
• 语种: 中文

摘要

为深入了解豫杂一号泡桐响应干旱胁迫的分子机制,以豫杂一号泡桐为材料,利用RNA-Seq测序技术对干旱胁迫后的豫杂一号泡桐的基因表达变化进行分析.通过比对分析,共鉴定出21911个差异表达基因,对这些差异基因进行GO功能分类,结果显示差异基因共参与了53个类别,集中在细胞、细胞过程、催化等功能类别.KEGG代谢通路分析结果显示,差异表达基因主要参与了"代谢通路""次生代谢物生物合成""光合作用"和"苯丙基生物合成".其中,水通道蛋白、糖转运蛋白、热休克蛋白70和胚胎发育晚期丰富蛋白差异表达量显著,这些基因可能是潜在的干旱胁迫响应基因.采用qRT-PCR技术验证了随机挑选的8个差异表达基因,结果与转录组测序数据趋势一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范国强	河南农业大学泡桐研究所	106	1402	22.0	31.0
2	曹喜兵	河南农业大学泡桐研究所	17	147	8.0	12.0
3	张雯宇	河南农业大学泡桐研究所	3	2	1.0	1.0
4	谢博洋	河南农业大学泡桐研究所	1	0	0.0	0.0