基于 PEG 胁迫表达谱发掘调控谷子干旱胁迫的泛素连接酶E3基因

• 作者: 侯思宇 刘龙龙 宋敏 张雁明 李红英 江璇宇 耿潞阳 韩渊怀 马芳芳
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 谷子 泛素连接酶 E3 干旱胁迫 表达谱
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 页码范围: 860-867
• 页数: 8页
• 分类号: S515
• 语种: 中文

摘要

[目的]探析谷子调控干旱胁迫的 E3基因。[方法]本文基于二代测序技术获得勾勾母鸡咀(GG)和晋汾16(JF)在 PEG 胁迫下的转录表达谱数据,运用生物信息学检索筛选出11个干旱相关的 E3基因,对其理化性质、功能域、启动子元件、表达模式以及与其它物种 E3基因的系统进化分析。[结果]蛋白等电点介于4.78~8.88之间,功能域主要为 ZF_UBR 型、ZF_RING 和 U_BOX 型三类,启动子序列包含干旱诱导响应元件 MBS 或脱落酸响应元件ABRE 等,其中 Si001665m 和 Si022170m 与 PUB22/23亲缘关系较近,Si029090m 与 PUB19亲缘关系较近。[结论]初步确定这些是调控谷子干旱胁迫的 E3候选基因,可能受干旱或脱落酸诱导表达,这为进一步研究谷子干旱响应相关的泛素连接酶 E3基因提供理论依据。