海子水牛瘤胃微生物的宏基因组学分析

• 作者: 夏海磊 岑宁 张慧敏 杨章平 毛永江 绪欣 黄强
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 海子水牛 瘤胃 宏基因组 微生物 木质纤维素降解酶
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 4151-4161
• 页数: 11页
• 分类号: S823
• 字数: 6673字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2017.11.039

摘要

为系统探讨海子水牛瘤胃内的微生物组成及木质纤维素降解酶系,本试验利用基于高通量测序的宏基因组学技术对海子水牛(2.5岁左右,平均体重为493 kg)瘤胃液样本进行组学分析.结果表明,共获得了77283638条reads,并拼接出744712个scaffold.经prodigal分析后,共预测出827044个基因.通过基因注释发现海子水牛瘤胃中含有多种木质纤维素降解微生物,如生黄瘤胃球菌(Ruminococcus flavefaciens)、白色瘤胃球菌(Ruminococcus albus)、产琥珀酸丝状杆菌(Fibrobacter succinogenes)及栖瘤胃普雷沃氏菌(Prevotella ruminicola).此外,还发现有38011个基因编码蛋白质具有木质纤维素降解酶活性,其中糖苷水解酶(GH)基因数量最多(17877个),糖基转移酶(GT)(8637个)、碳水化合物结合模块(CBM)(4693个)和碳水化合物酯酶(CE)基因(4214个)数量次之,多糖裂合酶(PL)(1296个)和辅助氧化还原酶(AA)基因(934个)数量较少.在GH基因中,归属于GH2、GH43、GH97、GH3家族的基因较多,且编码蛋白质具有寡糖降解酶活性的基因数量最多.此外还发现了少量的纤维小体组分蛋白基因.结合其他物种肠胃宏基因组中GH基因比对分析,发现海子水牛瘤胃中的纤维素酶、半纤维素酶和分支降解酶比例与奶牛瘤胃较为接近.由此可见,海子水牛瘤胃内含有丰富的木质纤维素降解微生物及酶系,这将为筛选具有工业应用潜力的酶基因奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	毛永江	扬州大学动物科学与技术学院	161	1081	17.0	24.0
2	杨章平	扬州大学动物科学与技术学院	200	1464	19.0	27.0
3	岑宁	扬州大学动物科学与技术学院	16	80	6.0	8.0
4	黄强	扬州大学动物科学与技术学院	84	220	8.0	11.0
5	张慧敏	扬州大学动物科学与技术学院	29	50	4.0	5.0
6	夏海磊	扬州大学动物科学与技术学院	7	18	1.0	4.0
7	绪欣	扬州大学动物科学与技术学院	6	15	1.0	3.0