巨魾线粒体12SrRNA和16SrRNA基因克隆及多态性分析

• 作者: 刘艳红 杜民 牛宝珍 艾加林 贾梦应
• 来源期刊: 西南大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 巨魾 12SrRNA基因 16SrRNA基因 系统进化
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 83-89
• 页数: 7页
• 分类号: Q959.4
• 字数: 3713字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13718/j.cnki.xdzk.2017.05.013

摘要

运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾DNA, 利用GenBank中鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆, 利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾的碱基含量、 遗传距离和系统进化树. 结果显示: ① 得到954 bp的12S rRNA基因序列和535 bp的16S rRNA基因序列各12条;② 12尾巨魾的12S rRNA基因、 16S rRNA基因以及12S rRNA基因和16S rRNA的合并基因序列的相似性分别为99.89%,99.95%,99.89%;③ 12尾巨魾的12S rRNA,16S rRNA均表现出A+T碱基含量高于G+C碱基含量;④ 12尾巨魾的平均遗传距离为0.002, 转换比颠换的平均值为3.065;⑤ 利用Neighbor-Joining(NJ)法构建的系统进化树表明魾属单独成一支, 支持率达到99%, 这一结果与传统的形态学分类基本相似.