计算机辅助CRISPR向导RNA设计

• 作者: 刘琦 啜国晖 王远立 石雷 闫继芳
• 来源期刊: 生物工程学报
• 关键词: CRISPR 基因编辑 计算机辅助向导RNA设计 脱靶
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 1744-1756
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13345/j.cjb.170182

摘要

基于CRISPR/Cas9系统的基因编辑已被成功应用于多种细胞类型中.计算机辅助的向导RNA (Guide RNA)设计是使用CRISPR系统成功进行基因编辑的关键步骤之一.目前的计算工作主要致力于利用计算模型来提高sgRNA的打靶效率并降低其脱靶.文中对于目前存在的sgRNA设计工具进行综述,并且说明可以通过建立高效的计算模型,对当前的异质基因编辑数据进行整合挖掘,以获得无偏差的sgRNA设计规则,并预测影响sgRNA设计的关键特征.笔者认为,对于sgRNA打靶和脱靶效果的系统总结和评价,将有助于使用CRISPR系统进行更加精准的基因编辑和基因治疗.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石雷	合肥工业大学计算机与信息学院	52	281	9.0	15.0
2	王远立	合肥工业大学计算机与信息学院	1	0	0.0	0.0
3	啜国晖	同济附属第十人民医院同济大学生命科学与技术学院生物信息学系	1	0	0.0	0.0
4	闫继芳	同济附属第十人民医院同济大学生命科学与技术学院生物信息学系	1	0	0.0	0.0
5	刘琦	同济附属第十人民医院同济大学生命科学与技术学院生物信息学系	1	0	0.0	0.0