基于ITS和trnl-trnF序列的新疆扁桃种质资源亲缘关系研究

• 作者: 周燕 张锐 徐崇志 朱玲 高山
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 扁桃 ITS trnl-trnF 植物学性状 系统发育
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 412-419
• 页数: 8页
• 分类号: S662.9
• 字数: 6784字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2017.03.013

摘要

为探究新疆扁桃种质的亲缘关系,以新疆‘纸皮’与‘阿曼尼沙’等24个扁桃种质为材料,对其叶片及果实的植物学性状进行对比分析.提取总DNA后分别对ITS与trnl-trnF序列进行PCR扩增、纯化及测序,将所测序列进行拼接及同源性比对.利用MEGA5软件构建基于ITS和trnl-trnF序列的不同扁桃种质间的系统发育树.通过植物学性状对比发现,‘矮丰’的叶形指数最高为4.12,‘叶尔羌’的出仁率为72.9％,在供试24个扁桃种质中最高.经相关生物信息学软件分析表明,ITS序列长度为608～610 bp,包括42个变异位点和9个简约信息位点,G+C含量为61.16％～61.90％. trnl-trnF序列长度为915～933 bp,其变异位点和简约信息位点丰富,分别为457个和332个,分别占总长的48.8％和35.7％,G+C含量较低,为32.46％～32.94％.基于ITS和trnl-trnF序列的系统发育树表明,ITS序列间的遗传距离为0.000～0.008,trnl-trnF序列间的遗传距离为0.000～0.400,‘双薄’与‘双软’具有相同的遗传背景.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高山	塔里木大学植物科学学院	37	318	10.0	16.0
2	周燕	塔里木大学生命科学学院	5	1	1.0	1.0