活性污泥DNA样品的保存条件对聚磷菌FQ-PCR结果的影响

• 作者: FUKUSHIMA Toshikazu MINO Takashi 杨敏 范念斯 齐嵘
• 来源期刊: 环境工程学报
• 学科: 地球科学
• 关键词: 荧光定量PCR PAOs DNA 保存方法
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1362-1368
• 分类号: X172
• 语种: 中文
• DOI: 10.12030/j.cjee.201511020

摘要

对目标微生物的准确定量是研究微生物群落的组成与功能的重要前提.荧光定量PCR技术作为目前流行的核酸定量分析技术,具有操作时间短,敏感性高,特异性强等特点,但也存在由客观因素导致实验结果出现显著误差的缺点.针对目前环境微生物定量方法中容易忽略的污泥样品DNA保存步骤与上机时间等环节,详细探讨了保存条件、上机批次对聚磷菌(PAOs)荧光定量PCR结果的影响.结果显示保存温度、保存时间均对标准质粒和污泥DNA样品中PAOs定量结果产生影响:模板DNA的浓度及保存时间会影响标准曲线Ct值的重复性;同一样品在相同保存温度(4℃)、不同保存时间、不同批次条件下的定量结果存在显著性差异(P＜0.05);相同样品在不同保存温度、不同保存时间、同一批次条件下定量结果存在显著差异(P＜0.05),平行保存于-20℃的污泥DNA样品不同保存时间、同一批次定量结果没有显著差异(P＞0.05).因此,在对活性污泥样品进行定量分析时,DNA样品应平行保存于-20℃条件,尽量避免反复冻融,并确保对比的生物样品保存及上机条件完全一致,从而减少定量结果误差.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨敏	中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室	237	4741	38.0	57.0
2	齐嵘	中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室	21	200	9.0	13.0
3	范念斯	中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室	3	3	1.0	1.0