基于正交设计的畜禽废水处理中活性污泥DNA的16S rDNA-PCR扩增体系

• 作者: 伍阳 叶红 曹伟 段莎丽 胡小梅 谢晴 邓仕槐
• 来源期刊: 农业环境科学学报
• 关键词: SBR 冻融 PCR扩增 正交设计
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 所属期刊栏目: 水体环境
• 页码范围: 2018-2022
• 页数: 5页
• 分类号: Q5-33
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1672-2043.2008.05.059

摘要

用SBR反应器处理畜禽废水,提取其中好氧活性污泥总DNA,比较3种物理破壁方法对DNA质量的影响,同时选择4个因素(DNA模板,Mg2+,dNTP,引物)对16S rDNA-PCR反应体系进行正交优化,并确定最适退火温度.结果表明,反复冻融法的DNA纯度大于玻珠振荡法和摇床振荡法,可不经纯化直接扩增;DNA浓度对PCR结果影响最大,Mg2+和dNTP浓度的影响次之且程度相同,引物浓度影响最小;最佳PCR扩增体系(25 μL)的组成为:模板DNA 0.32 μg,dNTP 200 μmol·L-1,Mg2+1.5 mmol·L-1,引物1.0μmol·L-1,Taq DNA聚合酶0.2U,且最适退火温度为56.5℃.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曹伟		4	28	2.0	4.0
2	邓仕槐	四川农业大学资源环境学院环境科学与工程系	68	778	14.0	25.0
3	伍阳	四川农业大学资源环境学院环境科学与工程系	4	44	2.0	4.0
4	谢晴	四川农业大学资源环境学院环境科学与工程系	5	37	2.0	5.0
5	段莎丽	四川农业大学资源环境学院环境科学与工程系	4	14	2.0	3.0
6	胡小梅	四川农业大学资源环境学院环境科学与工程系	1	0	0.0	0.0