不同引物对和退火温度对盐生植物盐穗木内参基因β-actin扩增效率的影响

• 作者: 曾幼玲 杨瑞瑞 白雪芹
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 盐穗木 不同引物对 退火温度 β-actin 扩增效率
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 页码范围: 352-360
• 页数: 9页
• 分类号: Q786
• 字数: 6235字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2017.02.019

摘要

[目的]以盐生植物盐穗木为材料,研究不同引物对和不同退火温度对盐穗木内参基因β-actin扩增效率的影响.[方法]设计扩增β-actin基因的两对引物,标记为β-actin1和β-actin2,分别建立这两对引物扩增盐穗木β-actin基因和特异性引物扩增该物种的过氧化物酶基因POD(盐响应的代表性基因),在不同退火温度下的标准曲线和扩增曲线.[结果]不论55还是58℃退火温度,引物对β-actin1比引物对β-actin2有更好的扩增效率;在55℃退火温度下,引物对β-actin1有更高的扩增效率.在这两个退火温度下,分别以β-actin1和β-actin2引物对扩增β-actin基因作为内参,盐穗木POD基因的相对表达水平具有一定的差异性.[结论]引物和退火温度会影响荧光定量PCR的扩增效率,进而会影响靶基因的相对表达水平.