应用Illumina MiSeq高通量测序技术分析河西走廊地区盐碱土壤微生物多样性

• 作者: 孔维宝 朱学泰 李海云 李渭娟 牛世全 胡山 达文燕 龙洋
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: Illumina MiSeq高通量测序 盐碱土 河西走廊
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 环境微生物
• 页码范围: 2067-2078
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13344/j.microbiol.china.160824

摘要

[目的]以甘肃省河西走廊地区的9个盐碱土壤样品(原生盐碱土、次生盐碱土、农田土)为材料,研究该地区盐碱土壤中微生物群落的多样性.[方法]提取土壤微生物总DNA,应用Illumina MiSeq高通量测序技术进行分析.[结果]从分布在河西走廊3个流域的9个盐碱土样品中共获得325 089条微生物的16S rRNA基因序列.冗余分析和热图分析表明,原生盐碱土与次生盐碱土、原生盐碱土与农田土微生物群落构成差异较大,次生盐碱土与农田土微生物群落差异较小.土壤pH对微生物群落组成的影响最显著.多样性指数和稀释性曲线分析得出,在9个土壤样品中,S6号Shannon指数最大,S1号Shannon指数最小,S1号Simpson指数最大,S6号Simpson指数最小,说明原生盐碱土的微生物群落多样性最低,次生盐碱土的微生物群落多样性最高.盐碱土壤中主要的微生物群落包括9个门,其中变形菌门占主导地位,其余依次是放线菌门、拟杆菌门、酸杆菌门、浮霉菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、厚壁菌门和疣微菌门.原生盐碱土和农田土中占优势的微生物群落是变形菌门,次生盐碱土中占优势的微生物群落是放线菌门.[结论]河西走廊地区盐碱土壤中微生物多样性非常丰富,存在大量的微生物类群,尤其是在次生盐碱土壤中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	达文燕	西北师范大学生命科学学院	40	526	13.0	21.0
2	孔维宝	西北师范大学生命科学学院	107	608	11.0	20.0
3	牛世全	西北师范大学生命科学学院	62	725	13.0	25.0
4	朱学泰	西北师范大学生命科学学院	25	283	8.0	16.0
5	李渭娟	西北师范大学生命科学学院	4	75	3.0	4.0
6	李海云	甘肃农业大学草业学院	5	76	3.0	5.0
7	龙洋	西北师范大学生命科学学院	5	75	3.0	5.0
8	胡山	西北师范大学生命科学学院	3	68	2.0	3.0