陆地棉KASⅡ酶蛋白结构分析

• 作者: 刘宝玲 吉夏洁 李润植 薛金爱 郝青婷
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 陆地棉 β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ) 油脂 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 505-509
• 页数: 5页
• 分类号: S562
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2017.04.04

摘要

β-酮脂酰-ACP合成酶Ⅱ(KASⅡ) (EC:2.3.1.179)是控制植物细胞脂肪酸合成和16c与18C脂肪酸比值的关键酶,亦是植物油脂代谢修饰的分子靶标.应用基因组学分析工具从陆地棉(Gossypium hirsutum)基因组鉴定获得一个与已知KA SⅡ高度同源的棉花KA SⅡ基因GhKA SⅡ,编码576个氨基酸肽链,其分子量为61.8 kDa,理论等电点为8.83.蛋白结构预测分析显示,GhKASⅡ蛋白为可溶性酶蛋白,具有质体转运肽,定位于质体中;GhKASⅡ蛋白二级结构主要形式为α-螺旋(32.99％)和无规则卷曲(36.63％).3D结构模拟表明,GhKASⅡ蛋白为同源二聚体,由2个相同的亚基构成,空间构型为紧密的心形结构.蛋白序列多重比对发现,GhKASⅡ与雷蒙德氏棉、亚洲棉、可可树的KASⅡ蛋白亲缘关系较近,植物KASⅡ蛋白C端保守性高,N端变异大.GhKASⅡ蛋白保守的酶催化活性域位于318-334位(氨基酸残基),其关键酶活位点是位于327位的半胱氨酸.研究结果可为深入解析棉花等油料作物的脂肪酸生物合成机制及油脂遗传改良提供科学参考.