陆地棉微管结合蛋白CLASP家族基因的鉴定及表达分析

• 作者: 朱守鸿 赵兰杰 刘永昌 李艳军 张新宇 孙杰
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 陆地棉 微管结合蛋白 微管 表达分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 389-398
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.00389

摘要

CLASP蛋白(CLIP-associated protein，CLASP)是一种调节微管结构与功能的微管结合蛋白，在植物生长发育及形态建成过程中起着至关重要的作用。本研究利用生物信息学的方法，在陆地棉基因组数据库中鉴定出6个编码CLASP蛋白的基因。多重序列比对及系统进化树分析表明，陆地棉CLASPs可分为2个亚家族(I和II)，亚家族I含有HEAT重复结构域和典型的CLASP-N端结构域，亚家族II只含有CLASP-N端结构域。实时荧光定量PCR结果表明，6个CLASPs基因在棉花各组织中均有表达，但表达模式各不相同，其中CotAD_63740(GenBank登录号为KX881965)和CotAD_04861(GenBank登录号为KX881961)在纤维中优势表达，CotAD_48232(GenBank登录号为KX881962)、CotAD_48665(GenBank登录号为KX881963)、CotAD_55570(GenBank登录号为KX881964)和CotAD_68468(GenBank登录号为KX881966)在茎中优势表达，表达模式的不同表明CLASPs在棉花不同组织中功能不同。本研究为深入研究棉花CLASPs的功能奠定了基础。