陆地棉SRO基因家族的鉴定及表达分析

• 作者: 吕有军 杨卫军 赵兰杰 姚金波 陈伟 李燕 张永山
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 陆地棉 逆境胁迫 SRO 基因组
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1468-1479
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2017.01468

摘要

SRO是植物特有的类RCD-ONE蛋白家族，在植物抵御各种生物和非生物胁迫过程中具有重要的作用。本研究利用生物信息学方法从陆地棉遗传标准系TM-1 (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1)基因组中鉴定到12个SRO基因家族成员。多重序列比对及进化树分析表明，12个陆地棉SRO均含有PARP和RST结构域，聚为3类，即A、B和C亚家族。转录组数据分析表明，TM-1全基因组中的Gh_D12G1442在茎中优势表达，Gh_D05G2064在萼片和雄蕊中优势表达; Gh_A05G3788在雄蕊中优势表达，Gh_A12G1318在雄蕊和纤维中优势表达; Gh_A12G2480、Gh_D12G2608、Gh_A05G2257和Gh_D05G2516在纤维中优势表达; Gh_A08G1390、Gh_D08G1685、Gh_A12G2663和Gh_D12G2054具有较为广泛的组织表达。逆境胁迫处理试验表明，Gh_A08G1390明显受冷处理和盐处理的诱导，Gh_D12G2054、Gh_D08G1685、Gh_A12G2663基因在不同的胁迫处理下受到不同程度的诱导。