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Fkbp51基因敲除小鼠心脏与肝脏RNA表达谱系的分析比较
Fkbp51基因敲除小鼠心脏与肝脏RNA表达谱系的分析比较
作者:
刘云波
武光东
王婷婷
邱彬
雍伟东
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
Fkbp51基因敲除小鼠
心脏
肝脏
代谢
基因表达
信号通路
摘要:
目的 通过分析野生型小鼠(WT)和Fkbp51基因敲除(KO)小鼠心脏与肝RNA表达谱系之间的差异,研究Fkbp51基因在心脏和肝组织代谢通路中的作用.方法 利用第二代高通量基因测序技术,对Fkbp51 KO和WT小鼠的心脏和肝进行mRNA表达谱测序,将心脏测序的数据结果用DEGseq进行差异分析,肝脏组织测序结果用BRB-Array Tools进行分析,分别筛选出小鼠心脏和肝的差异基因,利用在线工具DAVID对差异基因进行GO本体分析和KEGG通路分析,利用BioinfoGP数据库的Venn工具分析两种组织的共差异基因,利用STRING数据库对蛋白质的互作网络进行分析.结果 (1)Fkbp51的缺失导致心脏中血管平滑肌收缩、趋化因子信号、视黄醇信号和MAPK信号等相关通路的mRNA表达发生改变;(2)Fkbp51的缺失导致肝组织中胆固醇合成及代谢、脂类代谢以及氧化还原等相关基因和通路的变化;(3)在心脏和肝组织中,Fkbp51缺失造成了4个共差异基因,其中Rnaset2b、Hmga1和Fkbp51下调,而Cyp2b10在心脏组织中下调,在肝组织中上调.这些蛋白均可与HSP90蛋白相互作用,参与心脏和肝组织中的代谢.结论 Fkbp51在心脏和肝中参与不同的代谢及基因表达调控通路,其作用既是相互独立又是相互联系的.
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FKBP51
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高脂
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文献信息
篇名
Fkbp51基因敲除小鼠心脏与肝脏RNA表达谱系的分析比较
来源期刊
中国比较医学杂志
学科
医学
关键词
Fkbp51基因敲除小鼠
心脏
肝脏
代谢
基因表达
信号通路
年,卷(期)
2017,(7)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
1-5
页数
5页
分类号
R-33
字数
3795字
语种
中文
DOI
10.3969.j.issn.1671-7856.2017.07.001
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
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引文网络
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心脏
肝脏
代谢
基因表达
信号通路
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国比较医学杂志
主办单位:
中国实验动物学会
中国医学科学院医学实验动物研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1671-7856
CN:
11-4822/R
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区潘家园南里5号
邮发代号:
创刊时间:
1991
语种:
chi
出版文献量(篇)
4463
总下载数(次)
15
总被引数(次)
25033
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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