骨髓增生异常综合征患者骨髓微小RNA-340-3p的表达情况及生物信息学分析

• 作者: 乐颖 刘振芳 唐中源 张绪湃 文静 李虹颖 熊艳秋 程鹏 罗军 赖永榕 赵卫华 邓东红
• 来源期刊: 广西医学
• 学科: 医学
• 关键词: 骨髓增生异常综合征 基因芯片 微小核糖核酸 微小RNA-340-3p 靶基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 论著·临床研究
• 页码范围: 1285-1287,1308
• 页数: 4页
• 分类号: R511.3
• 字数: 3542字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11675/j.issn.0253-4304.2017.09.01

摘要

目的 探讨微小RNA(miR)-340-3p在骨髓增生异常综合征(MDS)患者骨髓中的表达情况,并应用生物信息学技术分析其靶基因及功能.方法 利用基因表达谱芯片结合分层聚类在9例MDS患者和6例健康正常人骨髓中筛选出差异表达的miR-340-3p,并利用miRBase和Miranda软件预测其靶基因,并对预测的靶基因进行功能富集和信号通路分析.结果 与健康正常人比较,miR-340-3p在MDS患者骨髓中表达下调(P<0.05).获得共同76个潜在靶基因,包括BANP、KIF2C、DIDO1、GRM1等.基因本体(GO)分析显示靶基因主要富集于细胞生物学、分子功能、细胞组分,信号通路分析显示其主要富集于FoxO信号通路、NOD样受体信号通路、造血细胞系、Gap连接等信号转导通路等.结论 miR-340-3p在MDS患者骨髓中表达下调,其可能通过靶向负向调控下游的靶基因而参与MDS的发生发展.