杭州市2013年-2014年甲型H3N2流感病毒PA基因的进化分析

• 作者: 刘诗川 岑斌 曾文芳 胡薇薇
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 甲型H3N2流感病毒 PA亚基 PA-X蛋白 进化分析
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 分子诊断与基因检测
• 页码范围: 1600-1604
• 页数: 5页
• 分类号: R373.1+3
• 语种: 中文

摘要

目的 分析2013年-2014年杭州市甲型H3 N2流感病毒PA基因及其编码蛋白的特征,揭示其分子特征与演化趋势.方法 对76株H3N2流感病毒PA基因进行扩增和测序,采用序列多重比对、突变位点比较分析、选择压力分析、系统发育分析等方法进行遗传进化分析.结果 76株流感病毒PA基因的核苷酸序列、编码蛋白序列及PA-X蛋白序列一致性分别为98.28％ ～ 100.00％、98.46％ ～ i00.00％和98.41％ ～ 100.00％;PA蛋白以及PA-X蛋白的氨基酸序列与参考株A/Ohio/2/2012相比,分别有15个位点和2个位点发生了显著的氨基酸突变;筛选到321、432共2个正向选择压力位点;构建系统进化树发现PA基因分2个支系,支系Ⅱ有2个分支,第3个流行高峰集中在分支ⅡC上.结论 杭州市2013年-2014年甲型H3N2流感病毒PA基因呈现出2个不同支系,编码蛋白的部分氨基酸位点发生了突变,个别位点具有正向选择压力,可能与病毒的复制能力和致病性的改变相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾文芳		10	50	4.0	7.0
2	岑斌		6	5	2.0	2.0
3	刘诗川		2	0	0.0	0.0
4	胡薇薇		2	10	1.0	2.0