RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因预测

• 作者: 吴亮亮 张玉平 李秋兰 王顺清 谢健晋 陈晓燕
• 来源期刊: 实用医学杂志
• 关键词: RYBP 白血病 二代测序 靶基因
• 年，卷（期）: 2017,（16）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 2620-2625
• 页数: 6页
• 字数: 4485字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-5725.2017.16.004

摘要

目的 探讨RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因.方法 利用慢病毒介导的RNA干扰技术,建立多批次RYBP基因稳定沉默的HL60细胞株及空载体对照组(NC);通过二代测序技术对不同批次干扰的上述3对细胞进行mRNA测序及miRNA测序,利用KEGG等生物信息学分析方法,预测靶基因.结果 成功构建RYBP稳定沉默的HL60细胞株.二代测序筛选出明显差异的mRNA及miRNA(P<0.05).Pathway显著性富集分析发现表达下调的基因与氨基酸合成,癌症转录调节紊乱,氨基酸代谢等相关的KEGG pathway有关,详见后述;沉默RYBP后,SPI1与hsa-miR-214-3p均表达降低(P<0.05).结论 RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因可能为:BBC3、BAI1、SESN2、CCNG2、JAK3、STAT4、SPI1、BCL6、CD11b和hsa-miR-214-3p.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张玉平	广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科	4	4	1.0	2.0
2	吴亮亮	广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科	3	4	1.0	2.0
3	王顺清	广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科	11	37	3.0	6.0
4	陈晓燕	广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科	2	2	1.0	1.0
5	谢健晋	广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科	2	6	1.0	2.0
6	李秋兰	广州医科大学附属广州市第一人民医院血液内科	1	1	1.0	1.0