甘蓝硫苷生物合成相关基因FMOGS-OXS的预测与分析

• 作者: 刘蕾 宋佳 王辉
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 十字花科 甘蓝 硫代葡萄糖苷 FMOGS-OX基因
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 22-25
• 页数: 4页
• 分类号: S635.03
• 字数: 3226字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.11.006

摘要

以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族FMOcS-oX位点基因全长编码区及蛋白为参考序列,在甘蓝(Brassica oleraceae L.)基因组数据库中进行Blastn和Blastp检索,得到具备Score≥100、E值≤10-10、coverage≥70％条件的甘蓝注释基因作为候选拟南芥FMOGS--OX的同源基因,并进一步进行同源性比较、基因结构比较及序列聚类分析.结果显示,在甘蓝中发现3个旁系同源基因Bol010993、Bol0291 00、Bol031350.甘蓝和拟南芥FMOGs-OX同源基因之间在核酸水平上的相似性为69.4％～83.0％;甘蓝3个FMOGa-OX旁系同源基因间的相似性保持在70.0％ ～84.0％.甘蓝Bol0 10993与拟南芥FMOGa-oX1～ FMOGs-oX4的结构较为相似,而Bol029100、Bol031350与拟南芥FMOGa-oX5的结构较相似.系统进化分析及共线性分析初步确定,甘蓝中分别存在1个FMO Gs-oX2(Bol010993)和2个FMOGs-ox5(Bol029100、Bol031350)基因.