甘蓝 GS －Elong 位点基因的预测与分析

• 作者: 刘蕾 宋佳 王珏 王辉
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 十字花科植物 甘蓝 硫代葡萄糖苷 GS -Elong
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术?遗传育种?种质资源
• 页码范围: 5-8
• 页数: 4页
• 分类号: S635|Q781
• 字数: 2929字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2016.03.002

摘要

以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族 GS －Elong 的全长 CDS 及蛋白序列为参考序列，在甘蓝（Brassica oleracea L．）基因组数据库中进行 BLASTN 和 BLASTP 检索，得到具备 Score≥100、E －value≤10－10和 Coverage ≥70％条件的甘蓝注释基因作为拟南芥 GS －Elong 位点基因的候选同源基因，并进一步对其进行同源性和基因结构比较及聚类分析。结果显示，在甘蓝 GS －Elong 位点发现4个旁系同源基因（Bol020647、Bol017070、Bol037823和 Bol017071）。甘蓝和拟南芥 GS －Elong 位点同源基因在核酸水平上的一致性为66．1％～84．3％；甘蓝4个旁系同源基因间的一致性在62．0％～83．7％之间。甘蓝和拟南芥 GS －Elong 位点基因在外显子数目、大小方面高度一致，但 Bol017071和 Bol037823分别较拟南芥 GS －Elong 位点基因少3个和1个外显子。系统进化及共线性分析初步确定，甘蓝中存在2个 BoMAM1（Bol017070和Bol020647）和2个 BoMAM3（Bol017071和 Bol037823）。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘蕾	青岛农业大学园艺学院	6	56	2.0	6.0
2	王辉	青岛农业大学园艺学院	48	174	6.0	10.0
3	王珏	青岛农业大学园艺学院	3	42	2.0	3.0
4	宋佳	青岛农业大学园艺学院	2	0	0.0	0.0