黄瓜抗坏血酸过氧化物酶基因的鉴定和特征分析

• 作者: 孟昭娟 曹齐卫 李利斌 杨宗辉 杨桂兰 王永强 纪复勤 韩梅香
• 来源期刊: 计算生物学
• 学科: 生物学
• 关键词: 黄瓜 抗坏血酸过氧化物酶基因 结构 系统进化 顺式元件
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 页码范围: 33-39
• 页数: 7页
• 分类号: Q94

摘要

植物抗坏血酸过氧化物酶基因在逆境应答和发育过程中具有重要功能,但是在我国重要蔬菜黄瓜中缺乏报道。本文通过生物信息学的方法,从黄瓜基因组中鉴定出6个抗血酸过氧化物酶基因,并对它们的染色体分布、基因结构、系统进化和顺式元件进行了系统分析。结果显示,黄瓜APX分布在不同的染色体上,编码区大小在750~1425 bp,含有8个以上外显子,预测编码蛋白定位在细胞质或者叶绿体中。它们都具有抗坏血酸过氧化物酶的特征结构域和磷酸化及豆蔻酰化位点。在它们的上游基因序列中,存在多个逆境和激素应答顺式调控元件,暗示它们在逆境应答中具有一定功能。