lprG基因表达上调对THP1细胞表达谱的影响

• 作者: 乐军 宛宝山 张冉冉 曹雯 陈伟伟 陈晋
• 来源期刊: 同济大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: lprG基因 THP1细胞 转录组测序
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 11-16
• 页数: 6页
• 分类号: R310.41
• 字数: 4630字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16118/j.1008-0392.2018.04.003

摘要

目的 分析lprG基因表达上调对THP1细胞表达谱的影响.方法 建立稳定表达lprG的THP1细胞系,通过qPCR及Western印迹法检测lprG的表达.用RNA-seq分析稳定表达1prG对THP1细胞基因表达谱有何影响.对测序数据进行分析,作GO及KEGG通路的显著性富集分析,并选取6个差异表达基因进行qPCR验证.结果 成功构建稳定表达lprG的THP1细胞系.RNA-seq检测发现共有712个差异表达的基因,其中419个上调,占58.8％,293个下调,占41.2％.富集分析显示,lprG的异位表达可影响THP1细胞多种生理或代谢过程.qPCR结果与RNA-seq结果一致.结论 lprG会影响THP1细胞内与Toll样受体信号通路、补体、细胞吞噬、溶酶体及过氧化物酶体等过程相关的基因的表达,这可为进一步研究lprG与巨噬细胞相互作用机制提供前期基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈晋	同济大学附属上海市肺科医院检验科	31	126	7.0	8.0
2	乐军	同济大学附属上海市肺科医院检验科	16	132	6.0	11.0
3	张冉冉	同济大学附属上海市肺科医院检验科	3	12	2.0	3.0
4	陈伟伟	同济大学附属上海市肺科医院检验科	2	6	1.0	2.0
5	曹雯	同济大学附属上海市肺科医院检验科	2	6	1.0	2.0
6	宛宝山	同济大学附属上海市肺科医院检验科	3	14	2.0	3.0