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贵州省2014-2017年麻疹病毒分离株血凝素基因特征
贵州省2014-2017年麻疹病毒分离株血凝素基因特征
作者:
任刚
刘淳婷
叶绪芳
唐小敏
戴丽芳
王寅寅
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
麻疹病毒
血凝素
基因型
序列分析
摘要:
目的 分析贵州省2014-2017年麻疹病毒分离株的血凝素(Hemagglutinin,H)基因特征.方法 采集贵州省2014-2017年疑似麻疹病例的咽拭子标本,采用Vero/SLAM细胞分离麻疹病毒,提取病毒核酸,经RT-PCR方法扩增麻疹病毒H基因全序列,对序列测定、拼接,分析基因特征.结果 共获得83株H基因全序列的麻疹病毒分离株,均为H1a基因型,且有2个明显分支(Cluster A和Cluster B).分离株H基因之间核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8%-100%和98.0%-100%;与Hla基因型参考株(China93-4)的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.6%-98.9%和98.2%-98.7%;与中国疫苗株(S191)的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.1%-94.5%和94.5%-95.2%.分离株均在第240氨基酸位点由丝氨酸变异为天冬酰胺(S-N),第243氨基酸位点由精氨酸变异为甘氨酸(R-G),处于Cluster A簇中的病毒株第397氨基酸位点由脯氨酸变异为亮氨酸(P-L).结论 贵州省2014-2017年麻疹病毒优势流行株为H1a基因型,且不同病毒传播链持续循环;麻疹病毒H蛋白基因的主要氨基酸位点未发生变异.
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文献信息
篇名
贵州省2014-2017年麻疹病毒分离株血凝素基因特征
来源期刊
中国疫苗和免疫
学科
医学
关键词
麻疹病毒
血凝素
基因型
序列分析
年,卷(期)
2018,(6)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
613-618,623
页数
7页
分类号
R373.11
字数
语种
中文
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主办单位:
中国疾病预防控制中心
出版周期:
双月刊
ISSN:
1006-916X
CN:
11-5517/R
开本:
大16开
出版地:
北京市宣武区南纬路27号
邮发代号:
创刊时间:
1995
语种:
chi
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