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不同基因型戊型肝炎病毒株宿主选择性差异的基因突变分析
不同基因型戊型肝炎病毒株宿主选择性差异的基因突变分析
作者:
付红伟
杨桂芳
王晨
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
戊型肝炎病毒
宿主
核酸决定子
摘要:
目的 初步探讨影响不同基因型戊型肝炎病毒(HEV)能否跨物种传播的核苷酸或氨基酸突变位点的特点.方法 从DNA序列GenBank数据库获得87株HEV全基因组序列,根据宿主选择不同的特点将其分为H类和Z类,其中H类为基因1型和2型,Z类为基因3型和4型.通过ALIGNX软件对两类中全部HEV全基因组序列进行比对分析,寻找影响两类HEV病毒株间宿主选择或致病性差异的可疑核苷酸或氨基酸突变位点.结果 本研究共发现26个可疑的核苷酸或氨基酸突变位点,可能参与决定不同基因型HEV宿主选择性差异;这些突变位点分布在ORF1区有16个,ORF2区有7个,ORF3区有1个,5'UTR和3'UTR区分别各有1个,特别是G11A/C(5'UTR区)、T511S(E2s蛋白决定簇区)及E78D(ORF3区)相对于其他突变子更为重要.结论 26个可疑特异性核苷酸或氨基酸突变位点的发现为研究不同基因型HEV宿主选择性和致病性差异提供了重要线索.
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文献信息
篇名
不同基因型戊型肝炎病毒株宿主选择性差异的基因突变分析
来源期刊
实用检验医师杂志
学科
关键词
戊型肝炎病毒
宿主
核酸决定子
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1-4
页数
4页
分类号
字数
3346字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7151.2018.01.001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王晨
天津医科大学总医院医学检验科
59
221
8.0
11.0
2
付红伟
天津医科大学总医院医学检验科
6
11
1.0
3.0
3
杨桂芳
天津医科大学总医院医学检验科
6
15
2.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
戊型肝炎病毒
宿主
核酸决定子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用检验医师杂志
主办单位:
中国医师协会
天津市天津医院
出版周期:
季刊
ISSN:
1674-7151
CN:
11-5864/R
开本:
大16开
出版地:
天津市河东区成林道220号(武警医学院附属医院)
邮发代号:
6-245
创刊时间:
2009
语种:
chi
出版文献量(篇)
998
总下载数(次)
2
总被引数(次)
2338
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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