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摘要:
目的 初步探讨影响不同基因型戊型肝炎病毒(HEV)能否跨物种传播的核苷酸或氨基酸突变位点的特点.方法 从DNA序列GenBank数据库获得87株HEV全基因组序列,根据宿主选择不同的特点将其分为H类和Z类,其中H类为基因1型和2型,Z类为基因3型和4型.通过ALIGNX软件对两类中全部HEV全基因组序列进行比对分析,寻找影响两类HEV病毒株间宿主选择或致病性差异的可疑核苷酸或氨基酸突变位点.结果 本研究共发现26个可疑的核苷酸或氨基酸突变位点,可能参与决定不同基因型HEV宿主选择性差异;这些突变位点分布在ORF1区有16个,ORF2区有7个,ORF3区有1个,5'UTR和3'UTR区分别各有1个,特别是G11A/C(5'UTR区)、T511S(E2s蛋白决定簇区)及E78D(ORF3区)相对于其他突变子更为重要.结论 26个可疑特异性核苷酸或氨基酸突变位点的发现为研究不同基因型HEV宿主选择性和致病性差异提供了重要线索.
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关键词云
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文献信息
篇名 不同基因型戊型肝炎病毒株宿主选择性差异的基因突变分析
来源期刊 实用检验医师杂志 学科
关键词 戊型肝炎病毒 宿主 核酸决定子
年,卷(期) 2018,(1) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 1-4
页数 4页 分类号
字数 3346字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1674-7151.2018.01.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王晨 天津医科大学总医院医学检验科 59 221 8.0 11.0
2 付红伟 天津医科大学总医院医学检验科 6 11 1.0 3.0
3 杨桂芳 天津医科大学总医院医学检验科 6 15 2.0 3.0
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研究主题发展历程
节点文献
戊型肝炎病毒
宿主
核酸决定子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
实用检验医师杂志
季刊
1674-7151
11-5864/R
大16开
天津市河东区成林道220号(武警医学院附属医院)
6-245
2009
chi
出版文献量(篇)
998
总下载数(次)
2
总被引数(次)
2338
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导