猪源戊型肝炎病毒上海株全基因组序列分析

• 作者: 刘佩红 周锦萍 张维谊 张苏华 曾容愚 陆承平
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 戊型肝炎病毒 RT-nPCR 序列分析 基因型
• 年，卷（期）: 2009,（2）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 165-168
• 页数: 4页
• 分类号: R373
• 字数: 2653字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2009.02.019

摘要

目的 分析猪源戊型肝炎病毒(HEV)上海株swChinash与已知其它 HEV 基因型的差异和人源 HEV 的关系.方法 设计22对PCR引物,分片段进行扩增,两末端采用快速扩增方法(RACE)扩增,扩增产物克隆到pMD18-T载体并测序,用DNASTAR软件与53株人源和猪源HEV的基因组进行同源性分析,用Clustalx和Mega3.0软件绘制基因进化树.结果 swChinash全序列除去poly(A)尾,由7 235个核苷酸组成,ORF1～3分别编码1707,660,122个氨基酸.全基因序列与Ⅳ型的核苷酸同源性为83.4%～84.7%,与其他三型为73.3%～76.3%,其中与中国人源长春株最高,为84.7%.结论 基于ORF1～3和全长基因组的进化树,猪源HEV上海株swChinash属于基因Ⅳ型,与其他Ⅳ型HEV亲缘关系较远,单独在一个进化分支上.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陆承平		387	5495	37.0	51.0
2	刘佩红		69	286	9.0	12.0
3	张维谊		57	196	7.0	10.0
4	周锦萍		89	317	10.0	13.0
5	曾容愚		2	32	2.0	2.0
9	张苏华		1	3	1.0	1.0