大额牛和牦牛胃型LYZ c基因多态性及其对消化功能的适应性分析

• 作者: 刘丽仙 张永云 张自芳 苗永旺 范新阳 邱立华 钱林东
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 农学
• 关键词: 大额牛和牦牛 胃型LYZ c基因 消化酶 序列分析 适应性分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 858-866
• 页数: 9页
• 分类号: S823.2
• 字数: 5708字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).201709004

摘要

[目的]为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应.[方法]采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化功能的适应性分析.[结果]在大额牛群体内共发现6个SNP位点,分别为c.196G>A、c.267T>C、c.270C>T、c.396C>T、c.423C>T和c.438C>G.在牦牛群体内共发现10个SNP位点,其中6个与大额牛共享,非共享的SNP位点分别为c.336G>C、c.348T>G、c.351T>C和c.375A>C.SNP196和SNP348为异义替换,引起p.G66S和p.H116Q氨基酸替换,但它们对大额牛和牦牛LYZ c的功能没有影响.在大额牛LYZ c基因中,共定义6种单倍型,确定了2种LYZ c蛋白变异体(Gayal1和Gayal2);而在牦牛LYZ c基因中,共定义12种单倍型,确定了3种LYZ c变异体(Yak1～Yak3);变异体Gayal1与Yak3、Gayal2与Yak1相同,而变异体Yak2为牦牛独有.大额牛、牦牛和普通牛胃型LYZ c变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致,但大额牛和牦牛变异体LYZ c等电点比普通牛S3型LYZ c更低.[结论]大额牛和牦牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丽仙	云南农业职业技术学院畜牧兽医学院	44	160	7.0	10.0
2	苗永旺	云南农业大学动物科学技术学院	102	531	13.0	17.0
3	张自芳	云南农业职业技术学院畜牧兽医学院	21	48	3.0	6.0
4	钱林东	云南农业职业技术学院畜牧兽医学院	25	85	5.0	8.0
5	张永云	云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心	29	113	6.0	10.0
6	范新阳	云南农业大学动物科学技术学院	7	2	1.0	1.0
7	邱立华	云南农业大学动物科学技术学院	4	1	1.0	1.0