库蠓核糖体DNA内转录间隔区1序列的测定与分析

• 作者: 侯晓晖 岑常活 常琼琼 段琛 韩晓静
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 库蠓 近似种 分子鉴定 系统发育 rDNA-ITS1
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1087-1094
• 页数: 8页
• 分类号: R384.5
• 字数: 6078字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2018.00.209

摘要

目的 测定核糖体DNA内转录间隔区1(nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer 1,rDNA-ITS1)序列进行库蠓种类鉴别与系统发育分析,以探究rDNA-ITS1序列在库蠓分子鉴定和系统发育研究方面的适用性.方法 采用DNA扩增、纯化、克隆及测序的方法获得荒川库蠓Culicoides arakawai、凹缘库蠓C.holcus、连斑库蠓C.jacobsoni、印度库蠓C.indianus、霍飞库蠓C.huffi和肩宏库蠓C.humeralis等6种库蠓的rDNA-ITS1序列,基于Kimura 2-parameter公式计算种内和种间遗传距离,应用MEGA 6.06软件分析DNA序列碱基组成并以环纹埃蠓Allohelea annulata为外群构建系统发育树(邻接法和最大似然法).结果 上述6种库蠓的rDNA-ITS1序列经过Clustal W比对及人工校对和编辑后的长度为352 bp,其中T、C、A、G4种碱基的含量分别为36.8％、13.0％、30.0％和20.1％,A+T的含量(66.8％)高于C+G的含量(33.1％);K-2p遗传距离在种内和种间具显著差异(t=32.430,P＜0.05);系统发育树中不同种类库蠓各自构成单系(群),同种类不同地理种群聚为一支,其与形态学鉴定结果一致.结论 本研究证实了rDNA-ITS1序列可用于进行库蠓及其近似种的分子鉴定和系统发育分析.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	侯晓晖		53	347	11.0	16.0
2	岑常活		6	1	1.0	1.0
3	韩晓静		9	21	2.0	4.0
4	常琼琼		9	20	2.0	4.0
5	段琛		7	18	2.0	4.0