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摘要:
目的 分析环状RNA(circular RNA,circRNA)在口腔鳞状细胞癌组织及癌旁组织中表达谱的差异及临床意义.方法 利用高通量芯片技术检测3例口腔鳞状细胞癌患者癌组织和配对癌旁组织中的差异表达circRNA,采用实时定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)方法验证所筛选的部分circRNA分子在45对口腔鳞状细胞癌组织与癌旁组织中的表达情况.分析上调明显的circRNA表达水平与口腔鳞状细胞癌临床病理特征的关系,采用Arraystar公司circRNA靶基因分析软件,预测可能与上调明显的circRNA相互作用的靶miRNA分子.结果 口腔鳞状细胞癌患者癌组织与癌旁组织样本间差异表达的circRNA共155个,其中上调45个,下调110个.所挑选的在口腔鳞状细胞癌组织上调或下调差异表达最显著的3条circRNA中RT-qPCR验证结果显示,与癌旁组织相比,口腔鳞癌癌组织中hsa_circ_0001874、hsa_circ_0001971、has_circ_0067934表达上调,hsa_circ_0000520、hsa_circ_0023944、hsa_circ_0000140表达下调,与芯片检测结果一致.在上述芯片筛选的口腔鳞状细胞癌组织特征circRNA表达谱中,hsa_circ_0001874上调表达最明显,hsa_circ_0001874的表达在不同临床分期及细胞分化程度存在显著差异;circRNA靶基因分析软件预测结果提示,miR-103a-3p、miR-107、miR-593-5p、miR-661和miR-662可能是hsa_circ_0001874的潜在靶基因.结论 多种circRNA在口腔鳞状细胞癌组织中呈异常表达,这些表达差异的circRNA及其潜在的靶基因可能与口腔鳞状细胞癌的发生、发展密切相关.
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文献信息
篇名 口腔鳞状细胞癌组织中环状RNA的差异表达谱分析
来源期刊 口腔疾病防治 学科 医学
关键词 环状RNA 口腔 鳞状细胞 癌旁组织 基因芯片 RT-qPCR 靶基因
年,卷(期) 2018,(2) 所属期刊栏目 专栏论著
研究方向 页码范围 83-89
页数 7页 分类号 R739.8
字数 4497字 语种 中文
DOI 10.12016/j.issn.2096-1456.2018.02.003
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 罗清 南昌大学第一附属医院检验科 48 89 6.0 7.0
2 黄自坤 南昌大学第一附属医院检验科 51 178 9.0 10.0
3 王军 南昌大学第二附属医院口腔颌面外科 42 160 7.0 10.0
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口腔
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基因芯片
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口腔疾病防治
月刊
2096-1456
44-1724/R
大16开
广州市江南大道南366号
46-225
1993
chi
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