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口腔鳞状细胞癌组织中环状RNA的差异表达谱分析
口腔鳞状细胞癌组织中环状RNA的差异表达谱分析
作者:
廖岚
欧阳少波
王军
罗清
赵思语
黄自坤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
环状RNA
口腔
鳞状细胞
癌
癌旁组织
基因芯片
RT-qPCR
靶基因
摘要:
目的 分析环状RNA(circular RNA,circRNA)在口腔鳞状细胞癌组织及癌旁组织中表达谱的差异及临床意义.方法 利用高通量芯片技术检测3例口腔鳞状细胞癌患者癌组织和配对癌旁组织中的差异表达circRNA,采用实时定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)方法验证所筛选的部分circRNA分子在45对口腔鳞状细胞癌组织与癌旁组织中的表达情况.分析上调明显的circRNA表达水平与口腔鳞状细胞癌临床病理特征的关系,采用Arraystar公司circRNA靶基因分析软件,预测可能与上调明显的circRNA相互作用的靶miRNA分子.结果 口腔鳞状细胞癌患者癌组织与癌旁组织样本间差异表达的circRNA共155个,其中上调45个,下调110个.所挑选的在口腔鳞状细胞癌组织上调或下调差异表达最显著的3条circRNA中RT-qPCR验证结果显示,与癌旁组织相比,口腔鳞癌癌组织中hsa_circ_0001874、hsa_circ_0001971、has_circ_0067934表达上调,hsa_circ_0000520、hsa_circ_0023944、hsa_circ_0000140表达下调,与芯片检测结果一致.在上述芯片筛选的口腔鳞状细胞癌组织特征circRNA表达谱中,hsa_circ_0001874上调表达最明显,hsa_circ_0001874的表达在不同临床分期及细胞分化程度存在显著差异;circRNA靶基因分析软件预测结果提示,miR-103a-3p、miR-107、miR-593-5p、miR-661和miR-662可能是hsa_circ_0001874的潜在靶基因.结论 多种circRNA在口腔鳞状细胞癌组织中呈异常表达,这些表达差异的circRNA及其潜在的靶基因可能与口腔鳞状细胞癌的发生、发展密切相关.
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文献信息
篇名
口腔鳞状细胞癌组织中环状RNA的差异表达谱分析
来源期刊
口腔疾病防治
学科
医学
关键词
环状RNA
口腔
鳞状细胞
癌
癌旁组织
基因芯片
RT-qPCR
靶基因
年,卷(期)
2018,(2)
所属期刊栏目
专栏论著
研究方向
页码范围
83-89
页数
7页
分类号
R739.8
字数
4497字
语种
中文
DOI
10.12016/j.issn.2096-1456.2018.02.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
罗清
南昌大学第一附属医院检验科
48
89
6.0
7.0
2
黄自坤
南昌大学第一附属医院检验科
51
178
9.0
10.0
3
王军
南昌大学第二附属医院口腔颌面外科
42
160
7.0
10.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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同被引文献
(7)
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1987(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
1997(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
2006(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
2007(1)
参考文献(0)
二级参考文献(1)
2008(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
2009(4)
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二级参考文献(4)
2010(2)
参考文献(0)
二级参考文献(2)
2011(5)
参考文献(0)
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参考文献(0)
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参考文献(2)
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参考文献(16)
二级参考文献(5)
2018(0)
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
2019(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
2020(1)
引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
环状RNA
口腔
鳞状细胞
癌
癌旁组织
基因芯片
RT-qPCR
靶基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
口腔疾病防治
主办单位:
广东省口腔医院
广东省牙病防治指导中心
出版周期:
月刊
ISSN:
2096-1456
CN:
44-1724/R
开本:
大16开
出版地:
广州市江南大道南366号
邮发代号:
46-225
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4006
总下载数(次)
4
总被引数(次)
12928
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