基于光学结构识别技术的化学知识库构建

• 作者: 刘振明 吕传宇 张亮仁 李明娜
• 来源期刊: 北京大学学报医学版
• 关键词: 科学文献 光学结构识别 数据挖掘 化学知识库
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 352-357
• 页数: 6页
• 分类号: R9-39
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-167X.2018.02.025

摘要

目的:构建了一种从科研文献提取关键信息建立化学知识库的流程.方法:使用名称转化技术和光学结构识别软件提取化合物结构,使用文献管理软件EndNote X8获取文献题录信息,使用机器学习工具ChemDataExtractor和人工注释方法提取文献内信息,使用计算模拟平台Pipeline Pilot 7.5获取可预测属性,关联开源数据库ChEMBL获取已知生物活性.结果:成功建立起一种合理、高效的化学知识库构建策略,并采用该策略构建了北京大学海洋天然产物库PKU-MNPD.结论:提出了一种化学知识库的数据汇聚策略,提高了化学知识库构建效率,并且基于原始文献使得构建的数据库内容准确、全面、易于检索.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘振明	北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室	30	27	3.0	3.0
2	张亮仁	北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室	50	57	4.0	6.0
3	吕传宇	北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	李明娜	北京大学药学院天然药物及仿生药物国家重点实验室	1	0	0.0	0.0