椰子织蛾转录组分析

• 作者: 任雪敏 刘乃勇 张枝全 徐志文 朱家颖 王俊 阎伟
• 来源期刊: 西南林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 椰子织蛾 转录组 基因 功能注释
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 38-45
• 页数: 8页
• 分类号: S433.4
• 字数: 4767字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11929/j.issn.2095-1914.2018.05.007

摘要

为获取入侵性检疫害虫椰子织蛾的基因信息,利用高通量测序技术对该害虫进行了转录组测序.结果表明:经拼接共获得了37416条unigenes,平均长度为803 bp,N50为1415 bp;通过BlastX比对,有19154条unigenes(51.19％)成功在Nr中被注释.在Nr中成功注释的uni-gene,与黑脉金斑蝶同源性最高,达到68.45％;在GO注释中,共有14131(37.76％)条uni-genes被成功注释到细胞组分、 分子功能和生物过程3大类的54个分支;在COG数据库中,成功注释的8606条unigenes被注释到26个分类;在KEGG中,共有6171条(16.49％)unigenes被注释到5大类通路的260条途径上.基于构建的转录组数据库,鉴定得到3248个微卫星.