一种基于RNA结合蛋白的RNA loop检测方法

• 作者: 刘广宇 张田伟 苏中静 黄东阳
• 来源期刊: 医学分子生物学杂志
• 学科: 军事
• 关键词: RNAloop RNA结合蛋白 RNA免疫沉淀 反向PCR
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 93-95
• 页数: 3页
• 分类号: E392.11
• 字数: 2050字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3870/j.issn.1672-8009.2018.02.007

摘要

目的 探索检测细胞内RNA loop存在的实验方法.方法 活细胞状态下交联蛋白核酸复合物、RNA免疫沉淀后在RNA不同位置设计引物,通过定量PCR结果间接检测RNA loop;另外,活细胞状态下交联蛋白核酸复合物后超声断裂核酸片段,相邻断端RNA连接后通过反向PCR的方法直接检测活细胞内RNA loop.结果 RNA结合蛋白在RNA的5′端和3′端结合水平高而中间段低,提示有可能存在RNA loop.反向PCR扩增测序获得远距离RNA片段的相连直接证实RNA loop的存在.结论 活细胞状态下交联蛋白核酸复合物然后检测RNA loop的技术,期望能为研究的RNA的高级结构和功能提供新的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄东阳	汕头大学医学院细胞生物学教研室	51	423	10.0	19.0
2	苏中静	汕头大学医学院组织学与胚胎学教研室	23	54	4.0	6.0
3	张田伟	汕头大学医学院组织学与胚胎学教研室	1	0	0.0	0.0
4	刘广宇	汕头大学医学院细胞生物学教研室	1	0	0.0	0.0