基于MethylRAD-Seq技术对仿刺参DNA甲基化图谱的研究

• 作者: 包振民 吕佳 孙红振 李仰平 李玉强 李语丽 牟闯 王师 王睿甲
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA甲基化 MethylRAD 仿刺参
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 41-50
• 页数: 10页
• 分类号: Q527
• 字数: 7392字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20170242

摘要

全基因组DNA甲基化作为重要的表观遗传学现象,其在生物体诸多生理生化过程中起了重要作用.研究表明全基因组DNA甲基化在基因的表达调控、维持胚胎正常发育、染色体结构稳定等方面发挥了重要作用.DNA甲基化也成为当今的研究热点之一,目前在脊椎动物领域研究相对较多,但是对无脊椎动物的甲基化规律的研究比较匮乏,因此本研究以棘皮动物门中仿刺参作为研究对象,采用最新的全基因组DNA甲基化检测方法MethylRAD-Seq技术探究了仿刺参三种组织的甲基化状况,得到了甲基化标签数量、甲基化位点分布以及甲基化标签密度等信息;此外通过整合仿刺参甲基化文库数据和表达谱数据发现基因甲基化水平与表达水平之间存在弱的正相关性,这暗示了无脊椎动物基因组DNA甲基化可能起到促进基因表达的作用.