浙江及周边地区猪流行性腹泻病毒S基因分子特征分析

• 作者: 刘亚杰 刘子琦 单颖 方维焕 施杏芬 李国炜 李肖梁 罗浩 陈聪
• 来源期刊: 浙江大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 S基因 分子特性 系统发育分析 抗原性分析
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 610-618
• 页数: 9页
• 分类号: S855.3
• 字数: 4628字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2017.06.231

摘要

对2013年4月至2017年4月间浙江省及周边24个地区共282份病料进行猪流行性腹泻病毒(porcine epidemicdiarrhea virus,PEDV)、轮状病毒A型(porcine group A rotavirus,GARV)、猪δ冠状病毒(porcine detacoronavirus,PDCoV)和猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)等病原的检测,并选取其中的16份PEDV阳性样品进行S基因克隆和序列分析.结果显示:PEDV的检出率为64.89％ (183/282),GARV为0.35％(1/282),PDCoV为4.25％(12/282),而未检出TGEV;PEDV在11月1日至次年4月1日间的累计检出率为74％,其余时间段的累计检出率为26％.对PEDV的S蛋白进行分子演化分析表明,PEDV可分为3个群,其中16份阳性样品均位于Ⅲ群,与疫苗毒株CV777、SM98和DR13株相比,核苷酸同源性为93.6％～95.2％,氨基酸同源性为92.4％～94.9％.16份PEDV阳性样品与中国PEDV的CV777疫苗毒株相比,形成了3个新的N-糖基化位点,破坏了1个N-糖基化位点.综上表明,当前仔猪腹泻主要病原为PEDV变异株,防控猪流行性腹泻需要注意季节的变化,也需要加快流行株疫苗的开发.