运用BioID技术筛选水稻GS3互作蛋白

• 作者: 冯嘉琳 刘赛 周泽娇 李洪清 杜荣裕 阳辉勇
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: BioID GS3 水稻 籽粒大小 互作蛋白
• 年，卷（期）: 2018,（6）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 771-780
• 页数: 10页
• 分类号: Q943
• 字数: 5922字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201803017

摘要

水稻异源三聚体G蛋白系统中的非典型γ亚基GS3,是一个控制籽粒大小的主效数量效应基因座,在调节籽粒大小中发挥负调控因子的功能.BioID (proximity-dependent biotin identification)为邻近蛋白标记技术,其工作原理是生物素连接酶能使其周围的蛋白带上生物素,同时生物素又能和链霉亲和素紧密结合,所以能够利用链霉亲和素偶联的磁珠富集目标蛋白.该技术具有灵敏、高效和周期短等特点,为筛选互作蛋白提供了新方法.为了解析GS3的蛋白调控网络,该研究以水稻原生质体为材料,采用BioID 技术对GS3在水稻中的互作蛋白进行了筛选.Western-blot结果表明:融合蛋白BirAG-GS3在原生质体中成功表达并生物素化GS3邻近蛋白.使用链霉亲和素磁珠富集生物素化后的蛋白,并进行蛋白质谱测序,获得了与GS3邻近的可能存在直接或间接互作的蛋白.将获得的蛋白进行功能富集与注释,并构建蛋白-蛋白互作网络.对部分蛋白进行了BiFC 验证,发现GS3可能与ICL、PPDK、RPN7和RH15发生相互作用,涉及能量代谢的调节、种子淀粉物质的储存、泛素-蛋白酶体系统以及凋亡途径等生物过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李洪清	华南师范大学生命科	27	447	12.0	20.0
2	杜荣裕	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0
3	周泽娇	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	冯嘉琳	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0
5	刘赛	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0
6	阳辉勇	华南师范大学生命科学学院广东省植物发育生物工程重点实验室	1	0	0.0	0.0