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PI3K/AKT信号通路与HER2阳性乳腺癌患者总生存时间的相关性及验证分析
PI3K/AKT信号通路与HER2阳性乳腺癌患者总生存时间的相关性及验证分析
作者:
南鹏
张竞尧
李慧
李春晓
王劲松
王婷
王海娟
窦娜
詹启敏
钱海利
马飞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
TCGA数据库
PI3K/AKT信号通路
HER2阳性乳腺癌
摘要:
目的 分析并验证与HER2阳性乳腺癌患者总生存时间相关的关键分子靶点.方法 首先,从TCGA数据库中分别下载Ⅰ/Ⅱ期和Ⅲ/Ⅳ期HER2阳性乳腺癌患者生存时间及转录组数据,将Ⅰ/Ⅱ期患者根据总生存时间分为2年和8.5年两组,先利用edgeR软件包分析两组乳腺癌患者的差异基因,随后对差异基因进行KEGG通路富集;将Ⅲ/Ⅳ期患者根据总生存时间分为2年和7年两组,利用edgeR软件包分析差异基因并对其进行KEGG通路富集;最后分析与Ⅰ/Ⅱ期和Ⅲ/Ⅳ期HER2阳性乳腺癌患者总生存时间均相关的共同调控通路.其次,利用KMplot (Kaplan-Meier plotter)数据库验证KEGG富集通路关键节点基因及其他基因与HER2阳性乳腺癌患者总生存时间之间的相关性.最后,利用HER2阳性乳腺癌细胞系BT474验证KEGG富集通路与抗HER2治疗耐药之间的相关性.结果 在Ⅰ/Ⅱ期HER2阳性乳腺癌患者中,总生存时间2年者PI3K/AKT信号通路处于上调差异基因富集信号通路的第9位,而在Ⅲ/Ⅳ期总生存时间2年者中,PI3K/AKT信号通路位于上调差异基因富集信号通路的第2位.在Ⅰ/Ⅱ期与Ⅲ/Ⅳ期总生存时间均2年的患者共同上调的差异基因中,PI3K/AKT信号通路被富集于第1位.在PI3K/AKT通路中,PI3K和AKT(关键节点基因)、CFAP221和COL4A6(通路其他基因)高表达的患者总生存时间短于低表达患者.细胞验证实验显示,PI3K抑制剂能够增强HER2小分子抑制剂对HER2阳性乳腺癌细胞系BT474的生长抑制作用.结论 PI3K/AKT通路过度激活与HER2阳性乳腺癌患者总生存时间短相关,并与HER2阳性乳腺癌细胞抗HER2治疗耐药相关.
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文献信息
篇名
PI3K/AKT信号通路与HER2阳性乳腺癌患者总生存时间的相关性及验证分析
来源期刊
解放军医学杂志
学科
医学
关键词
TCGA数据库
PI3K/AKT信号通路
HER2阳性乳腺癌
年,卷(期)
2018,(3)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
217-223
页数
7页
分类号
R737.9
字数
5364字
语种
中文
DOI
10.11855/j.issn.0577-7402.2018.03.07
五维指标
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
TCGA数据库
PI3K/AKT信号通路
HER2阳性乳腺癌
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
解放军医学杂志
主办单位:
人民军医出版社
出版周期:
月刊
ISSN:
0577-7402
CN:
11-1056/R
开本:
大16开
出版地:
北京100036信箱188分箱
邮发代号:
2-74
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
8116
总下载数(次)
11
总被引数(次)
57068
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
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