四川省鼠疫耶尔森菌CRISPR基因分型及地区分布研究

• 作者: 刀吉 刘建 廖虹瑜 曾林子 李伟 李帆 杨军 梁莹 段风刚 汪立茂 王宏 祁腾 罗隆泽 谢飞 谭文明 金忠强 雷高鹏
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鼠疫 四川省 CRISPR 分子分型
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 801-804,810
• 页数: 5页
• 分类号: Q786|S855.2
• 字数: 3086字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2018.00.168

摘要

目的 对四川省鼠疫耶尔森菌(Yersinia pestis)做规律成簇的间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats CRSIPR)基因分型和地区分布研究,为四川鼠疫防治提供科学依据.方法 对132株鼠疫菌培养和提取核酸,应用3对CRISPR引物对被试菌株DNA进行PCR扩增、测序和分析,确定四川省鼠疫菌的CRSIPR基因型.结果 132株鼠疫菌共发现17种spacer,包括YPa 9种、YPb 5种、YPc 3种,新发现的1种space阵列.所有鼠疫菌株被分为2个CRISPR基因簇(Cc3',Ca7),3个基因型(37'型、22型和sc01型).其中石渠县青海田鼠型菌株基因型为37'型,石渠县人间鼠疫的菌株为22型,德格县旱獭型菌株基因型为22型,巴塘县、理塘县、雅江县和新龙县旱獭菌株基因型为sc01型.结论 四川省鼠疫菌菌株具有明显的地区分布特征.