鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究

• 作者: 包静月 周冬生 宋亚军 崔百忠 张玲 张秀清 戴二黑 李敏 杜宗敏 杨瑞馥 汪建 王效义 王津 祁芝珍 童宗中 翟俊辉 裴德翠 郭兆彪 金丽霞 韩延平 黄培堂
• 来源期刊: 解放军医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 耶尔森氏菌,鼠疫 DNA芯片 基因组进化 生态位适应
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 专题研究
• 页码范围: 204-210
• 页数: 7页
• 分类号: R378.6+1
• 字数: 7607字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0577-7402.2004.03.005

摘要

目的探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系.方法对36株鼠疫耶尔森菌和7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析,鉴定差异区段(DFR),并对260株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布,同时进行基因组岛分析.结果在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出22个DFR,基于DFR图谱,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成14个基因组型.鼠疫耶尔森菌共有21个基因组岛,其中18个已存在于假结核杆菌中,余下3个为鼠疫耶尔森菌独有. 结论探明了各基因组岛在鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌间的差异分布,探究了鼠疫耶尔森菌的起源进化;建立了鼠疫耶尔森菌基因组分型系统;建立了各基因组型别间的系统发育关系,初步揭示了鼠疫耶尔森菌基因组的进化规律及其与鼠疫耶尔森菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系,基本探明了鼠疫耶尔森菌在中国的演化规律.