茶藨子属ITS2序列二级结构的预测和比较分析

• 作者: 刘虹 薛青 覃瑞 黄文
• 来源期刊: 中南民族大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 茶藨子属 ITS2 二级结构 聚类分析
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 42-47
• 页数: 6页
• 分类号: Q751
• 字数: 2669字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-4321.2018.03.010

摘要

目的:利用内转录间隔区2(ITS2)序列对茶藨子属30个物种进行分类鉴定. 方法:利用Clustal W软件多序列比对分析从Genbank上下载的ITS2序列,通过MEGA7.0软件计算遗传距离( K2P),基于K2P模型构建邻接(NJ)聚类树,并用RNA Structure5.4软件分析各物种ITS2二级结构的差异. 结果:从构建的聚类树可知,茶藨子属30个物种均聚为1大枝11个小分枝,说明茶藨子属是一个单系类群;根据ITS2的二级结构分析,该属所有物种都均具有相似的结构,说明了该属的特异性较强,同时也说明了ITS2序列分析适用于茶藨子属植物的分类鉴定,并在近缘物种间的系统学研究、物种的鉴定方面具有较大的应用潜力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	覃瑞	中南民族大学生命科学学院武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室	82	451	12.0	18.0
2	刘虹	中南民族大学生命科学学院武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室	58	185	7.0	11.0
3	薛青	中南民族大学生命科学学院武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室	1	1	1.0	1.0
4	黄文	中南民族大学生命科学学院武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室	4	3	1.0	1.0