大白菜KASP反应体系的优化与建立

• 作者: 原玉香 姚秋菊 张晓伟 杨双娟 王志勇 赵艳艳 魏小春
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 KASP 反应体系优化
• 年，卷（期）: 2018,（12）
• 所属期刊栏目: 新技术与新方法
• 页码范围: 2442-2452
• 页数: 11页
• 分类号: S634.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0274

摘要

以大白菜基因组DNA为模板,对影响竞争性等位基因特异性PCR (Kompetitive allele specific PCR,KASP)的反应体积、引物浓度和DNA模板用量等3个参数进行优化,建立了适用于大白菜的KASP反应体系.96孔模块最佳反应体系中,总反应体积为8 μL,其中模板DNA (60 ～ 80 ng·μL-1)1 μL,KASPMastermix (2×)4μL,引物混合物(50 μmol·L-1) 0.14 μL,ddH2O 3 μL.384孔模块最佳反应体系中,总反应体积为4 μL,其中模板DNA(60～80 ng· μL-1)1 μL,KASP Master mix (2×)2μL,引物混合物(50 μmol·L-1)0.07 μL,ddH2O 1μL.利用不同引物和不同的大白菜材料对优化的反应体系进行验证,均获得了较好的KASP-SNP分型,验证了该优化体系的稳定性.该反应体系可以用于大白菜遗传多样性研究、基因定位、遗传图谱构建等遗传学研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓伟	河南省农业科学院园艺研究所	80	716	17.0	23.0
2	原玉香	河南省农业科学院园艺研究所	58	606	17.0	23.0
3	姚秋菊	河南省农业科学院园艺研究所	57	292	11.0	15.0
4	王志勇	河南省农业科学院园艺研究所	59	91	5.0	8.0
5	魏小春	河南省农业科学院园艺研究所	26	50	4.0	6.0
6	赵艳艳	河南省农业科学院园艺研究所	28	63	4.0	7.0
7	杨双娟	河南省农业科学院园艺研究所	6	0	0.0	0.0