妊娠期糖尿病相关基因的生物信息学分析

• 作者: 刘昌玲 李娜 杨宇 涂红勤
• 来源期刊: 华南国防医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 妊娠期糖尿病 表达谱 基因芯片 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 309-313
• 页数: 5页
• 分类号: R714.256
• 语种: 中文
• DOI: 10.13730/j.issn.1009-2595.2018.05.006

摘要

目的 基于芯片数据采用生物信息学方法,挖掘与妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)进展相关的信号通路和潜在差异表达基因.方法 在GEO数据库中筛选GDM表达谱芯片数据,并通过生物信息学方法进行再次分析.结果 在GEO数据库获得GSE87295、GSE51546芯片数据,将共同差异表达基因信号通路富集获得上皮-间充质转换通路、间充质-上皮转换通路和低氧诱导因子1α转录因子与GDM相关的3条显著相关的信号通路,及调控这些信号通路的13个差异表达基因.通过基于本体的医学信息检索平台(Coremine Medical)发现3个基因与GDM有文献共线相关.通过Gene Mania工具分析发现所有筛选的基因之间都有间接或直接的共表达关系.结论 通过对芯片数据再次分析,筛选出3条信号通路及13个差异表达基因与GDM发生发展相关.