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鸡PPARγ基因相关长链非编码RNA的鉴定及其转录调控
鸡PPARγ基因相关长链非编码RNA的鉴定及其转录调控
作者:
姜修英
李辉
杜志强
武春艳
董翔宇
高卓然
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鸡
脂肪生成
过氧化物酶体增殖物激活受体γ基因(PPARγ)
长链非编码RNA (lncRNA)
转录调控
摘要:
哺乳动物中的研究发现长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)参与过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARγ)基因的转录调控,进而影响脂肪细胞的增殖和分化.为了探究鸡(Gallus gallus)中是否存在lncRNA能够调控PPARγ基因的表达,进而影响脂肪细胞的分化,本研究利用生物信息学方法分析鸡的RNA-seq数据,筛选到1条长度为1483 bp的长链非编码RNA(命名为PLNC),其位于鸡PPABγ基因第一内含子处,并与PPARγ基因具有一致的转录方向.随后利用qRT-PCR方法分析发现,在鸡1、4、7周龄脂肪组织中,PLNC和PPARγ转录本1(cPPARγ1)的表达量相对较高.直接分离爱拨益加(Arbor Acres,AA)鸡12日龄腹部脂肪组织中的前脂肪细胞和成熟脂肪细胞,发现PLNC与PPARγ和cPPARγ1在前脂肪细胞中的表达量均显著高于成熟脂肪细胞.鸡前脂肪细胞诱导分化过程中,PLNC与PPARy和cPPARγ1的转录水平表达趋势一致.PLNC干扰片段与启动子报告基因共转实验表明,抑制PLNC可以显著提高cPPARγ1启动子活性.最后,不同浓度罗格列酮(rosiglitazone)处理前脂肪细胞24h后,发现随着罗格列酮浓度上升,PLNC和cPPARγ1表达量均先上升,而当cPPARγ1表达量上升到最高点时PLNC表达量开始下降.综上所述,本研究发现PLNC可能竞争性调控cPPARγ1的启动子活性和转录水平,从而参与鸡脂肪细胞分化过程.研究结果为鸡脂肪组织生长发育的分子调控机制研究提供了新的线索,也为减少腹部脂肪沉积、以及肥胖症和代谢相关疾病的治疗提供了分子依据.
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生物信息学分析
长链非编码RNA对肿瘤发生调控的研究进展
长链非编码RNA
肿瘤的发生发展
长链非编码RNA与心力衰竭的关系
心力衰竭
长链非编码 RNA
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文献信息
篇名
鸡PPARγ基因相关长链非编码RNA的鉴定及其转录调控
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
鸡
脂肪生成
过氧化物酶体增殖物激活受体γ基因(PPARγ)
长链非编码RNA (lncRNA)
转录调控
年,卷(期)
2018,(11)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
1909-1918
页数
10页
分类号
S831.2
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2018.11.010
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
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引文网络
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参考文献
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鸡
脂肪生成
过氧化物酶体增殖物激活受体γ基因(PPARγ)
长链非编码RNA (lncRNA)
转录调控
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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