基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌的表达及预后意义

• 作者: 严长宝 孙美涛 李彬 梅雯 熊伟 王唯斯 自加吉
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: 肝细胞癌 MTERF3 数据挖掘 预后
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 开发与应用
• 页码范围: 484-491
• 页数: 8页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2018.05.0084

摘要

[目的]线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)是线粒体基因复制和转录的负调控因子,但目前尚未见其在肝细胞癌中的系统研究.该研究基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌(hepatocelluar carcinoma,HCC)及正常肝组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF3基因对肝细胞癌患者预后的影响.[方法]利用Oncomine数据库分析MTERF3基因mRNA在正常肝组织和肝细胞癌组织中的表达变化.通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)人体正常组织和其相应的肿瘤组织中MTERF3基因的表达差异.通过cBioportal分析MTERF3基因在肝细胞癌组织中的突变情况.经MethHC数据库分析肝细胞癌和正常肝组织中MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平的差异.利用OncoLnc数据库对MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验.在String-DB数据库中探索在线粒体DNA表达调控过程中与MTERF3基因关系密切的相关基因.[结果]与正常肝组织相比,肝细胞癌组织中MTERF3基因在mRNA水平呈显著高表达(P≤0.05),MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平显著降低(P≤0.05).肝细胞癌组织中MTERF3基因存在错义突变,导致其编码蛋白质的243位甲硫氨酸突变为缬氨酸(M243V).MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者的总生存时间存在相关性(Logrank P≤0.05),MTERF3基因高表达的肝细胞癌患者总生存时间显著缩短.MFN1、MFN2、VDAC1、ATG12、UBA52、UBB、UBC、PINK1、SQSTM1、RPS27A等基因与MTERF3基因有明显的相互作用.[结论]大样本数据挖掘能迅速地获取肝细胞癌组织中MTERF3基因表达的相关信息,为深入研究MTERF3基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李彬		9	2	1.0	1.0
2	熊伟		54	97	6.0	8.0
3	孙美涛		27	57	4.0	6.0
4	梅雯		26	43	3.0	6.0
5	自加吉		27	28	2.0	4.0
6	王唯斯		23	8	2.0	2.0
7	严长宝		4	0	0.0	0.0