利用SSR标记分析东北野生菰遗传多样性和遗传结构

• 作者: 吴建利 张孝天 江绍玫 江绍琳 牛恋 王惠梅 苏晓娜 董琳 谢小燕 黄雪雯
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 野生菰 SSR标记 生物统计分析软件 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术与工程
• 页码范围: 579-589
• 页数: 11页
• 分类号: Q943
• 字数: 6323字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13836/j.jjau.2018075

摘要

菰属(Zizania Trucz.)为水稻的近缘属,保留了大量驯化作物所丢失的优异性状,是扩大和丰富育种基因库的理想材料.从24对菰SSR分子标记中筛选出7对标记,对来自东北三省的5个居群,共计98个野生菰样本进行了遗传多样性和遗传结构分析.同时,详细阐述了POPGENE、STRUCTURE、ARLEQUIN、MEGA及MVSP等统计分析软件的数据录入格式、软件操作方法,为相关领域的研究者提供完整可操作的参考依据.各软件分析结果表明:东北地区野生菰具有较为丰富的遗传多样性(PPB=71.88％、Ao=1.719、Ae=1.332、He=0.201、I=0.313,Gst=0.543);各野生菰居群间的遗传相似性系数和遗传距离分别介于0.6055～0.9556和0.0454～0.5016;东北地区野生菰的遗传变异主要存在于居群间;5个野生菰居群的遗传结构可以大致分为3组,5个居群不存在明显的亲缘地理关系.该研究结果不仅有助于加深对我国东北地区野生菰资源遗传多样性和遗传结构的认识,同时也为东北野生菰种质资源保护提供一定理论依据.