国产血浆游离DNA提取试剂盒的性能评价

• 作者: 吴玉梅 吴茵 朱菊平 潘杰 赵兰静 赵琪 黄学文
• 来源期刊: 江苏大学学报（医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 硅胶吸附柱 核酸提取 游离DNA 评价
• 年，卷（期）: 2018,（2）
• 所属期刊栏目: 检验医学
• 页码范围: 163-168
• 页数: 6页
• 分类号: Q523
• 字数: 3778字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13312/j.issn.1671-7783.y180003

摘要

目的:对国产血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)提取试剂盒进行评价.方法:用志愿者血浆构成血浆池A,再分别加入固定量片段长度为102、268、402 bp和所有片段混合物的DNA,形成血浆池B1-B4.用Qiagen和国产柱式法cfDNA提取试剂盒分别提取血浆池A和血浆池B1-B4中的cfDNA.用TaqMan qPCR分析两种试剂盒提取血浆池A中cfDNA的提取效率,同时分析cfDNA浓度与血浆用量之间的关系,用琼脂糖凝胶电泳分析提取的cfDNA的片段完整性.核酸测定仪分析两种试剂盒对血浆池B1-B4中不同DNA片段的回收率.结果:Qiagen和国产试剂盒提取的血浆池A中cfDNA的Ct值分别为27.94±0.423和27.41±0.356,国产试剂盒提取效率明显高于Qiagen试剂盒(t=4.29,P＜0.01);琼脂糖凝胶电泳结果表明,两种方法提取的血浆池A中cfDNA在102、268和402 bp处均出现明显条带,而1 204 bp片段未出现.Qiagen和国产试剂盒提取的cfDNA浓度与血浆池A的血浆用量之间均存在明显的线性相关,r2分别为0.979(P ＜0.01)和0.963(P ＜0.01).Qiagen和国产试剂盒提取的血浆池B1-B4血浆中102、268、402 bp及其昆合物的回收率分别为64.81％ ±4.27％,80.40％±4.31％,88.40％±6.11％,83.50％ ±5.21％和73.50％±5.33％,85.20％±4.49％,89.30％ ±5.91％,85.64％±4.48％,两者在102和268 bp片段的回收率上差异显著(t=5.69,P＜0.01;t =3.44,P＜0.01),而在402 bp及混合物的回收率上无明显差异(t =0.47,P＞0.05;t 1.39,P＞0.05).结论:国产cfDNA提取试剂盒在各项评价性能上均可与Qiagen产品媲美.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵兰静	华东疗养院检验科	11	18	3.0	3.0
2	朱菊平	华东疗养院检验科	7	31	2.0	5.0
3	赵琪	南京医科大学附属无锡人民医院检验科	23	146	6.0	11.0
4	潘杰	华东疗养院检验科	8	13	2.0	3.0
5	吴玉梅	华东疗养院检验科	5	5	1.0	2.0
6	吴茵	华东疗养院检验科	5	4	1.0	2.0
7	黄学文	华东疗养院检验科	13	54	3.0	7.0