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茶树CSD1基因及其启动子克隆与低温胁迫下的表达
茶树CSD1基因及其启动子克隆与低温胁迫下的表达
作者:
傅海峰
常笑君
张舒婷
朱晨
李小桢
林玉玲
王仲
赖钟雄
赵姗姗
郭玉琼
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
茶树
CSD1基因
低温胁迫
表达分析
摘要:
低温寒害严重影响茶树的生长发育状况及成品茶品质,Copper/zinc-superoxide dismutase(CS)基因在植物抗胁迫响应中起着关键作用.为了解茶树CSD基因(CsCSD)响应低温胁迫的作用机制,以铁观音茶树叶片为供试材料,采用同源克隆结合RACE方法及染色体步移法,获得茶树CSD1基因的cDNA序列(GenBank登录号:KR078346)、gDNA序列及其启动子序列,并对其进行生物信息学分析,同时对低温胁迫处理下CsCSD1基因的表达模式也进行分析.结果显示,茶树CsCSD1基因cDNA全长860 bp,完整的开放阅读框(ORF)长度为459 bp,共编码152个氨基酸;gDNA基因结构分析发现CsCSD1基因由6个外显子和5个内含子构成;CpG岛预测发现启动子区域内存在1个CpG岛,CpG长度为219 bp,GC含量为50.3%;CsCSD1启动子上还存在大量的顺式作用元件,包括光响应元件、激素响应元件、胁迫响应元件和其他响应元件;在低温胁迫下CsCSD1基因的表达模式显示,在低温胁迫前期,CsCSD1基因表达上调;随后CsCSD1基因的表达量不断下降.本研究表明,CsCSD1基因能够响应低温胁迫并在胁迫的不同时期发挥不同的作用,推测与低温胁迫密切相关.
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篇名
茶树CSD1基因及其启动子克隆与低温胁迫下的表达
来源期刊
应用与环境生物学报
学科
农学
关键词
茶树
CSD1基因
低温胁迫
表达分析
年,卷(期)
2018,(5)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1122-1131
页数
10页
分类号
S571.1|Q78
字数
语种
中文
DOI
10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.02021
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
赖钟雄
473
4127
31.0
41.0
2
郭玉琼
37
403
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19.0
3
赵姗姗
7
26
3.0
5.0
4
王仲
9
34
4.0
5.0
5
林玉玲
148
560
10.0
16.0
6
朱晨
13
28
4.0
5.0
7
李小桢
6
4
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2.0
8
傅海峰
6
4
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2.0
9
常笑君
9
28
3.0
5.0
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张舒婷
11
2
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1.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
二级参考文献
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共引文献
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研究去脉
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应用与环境生物学报
主办单位:
中国科学院成都生物研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1006-687X
CN:
51-1482/Q
开本:
大16开
出版地:
成都市人民南路4段9号
邮发代号:
62-15
创刊时间:
1995
语种:
chi
出版文献量(篇)
3881
总下载数(次)
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