结核分枝杆菌调节miRNAs及circRNAs抗细胞自噬机制的生物分析

• 作者: 付玉荣 伊正君 张益源 罗嘉婧
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 巨噬细胞 自噬基因 miRNA circRNA 相互作用
• 年，卷（期）: 2018,（10）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 888-894,907
• 页数: 8页
• 分类号: R378.91
• 字数: 3500字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2018.00.165

摘要

目的 探索结核分枝杆菌抵抗人或小鼠巨噬细胞自噬机制的关键miRNAs及circRNAs,为寻找新型结核诊断标志物及治疗靶点提供思路.方法 筛选出结核分枝杆菌诱导细胞差异表达的自噬相关基因;制作蛋白交互图并文献挖掘筛选关键自噬基因;多数据库综合预测相应的miRNA,制作自噬基因mRNA-miRNAs交联图并筛选关键miRNA;制作miRNAs-circRNAs相互作用图并筛选关键circRNA.结果 筛选出18种结核感染后差异表达的自噬相关基因,并在此基础上预测16种自噬关键基因;筛选出4种通过靶向自噬mRNA参与自噬调控的关键miRNA分子(miR-17-5p,miR-20a-5p,miR-30a-5p,miR-33-5p);针对4种miRNA筛选出6种与其密切相关的circRNA分子,并预测hsa-circRNA2908和hsa-cir-cRNA6439是影响结核抗自噬关键circRNA分子.结论 miR-miR-17-5p,miR-20a-5p,miR-30a-5p,miR-33-5p及其上游共同调控分子hsa-circRNA2908和hsa-circRNA6439可能是潜在的诊断标志物和疾病治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付玉荣	潍坊医学院临床医学院	136	281	8.0	9.0
2	伊正君	潍坊医学院医学检验学系	135	257	8.0	8.0
3	张益源	潍坊医学院临床医学院	3	3	1.0	1.0
4	罗嘉婧	潍坊医学院医学检验学系	2	3	1.0	1.0