木薯及其同源四倍体基因组与DNA甲基化差异分析

• 作者: 严华兵 周慧文 尚小红 肖亮 谢向誉 陈松笔
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 木薯 二倍体 同源四倍体 DNA甲基化 遗传差异
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 作物栽培与营养、遗传育种
• 页码范围: 833-839
• 页数: 7页
• 分类号: S533
• 字数: 3954字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2018.05.001

摘要

为研究染色体加倍对木薯基因组的影响,以及多倍化与2种不同倍性木薯之间DNA碱基序列的变化的联系.本研究以木薯品种“新选048”二倍体及其同源四倍体为研究材料,使用微卫星(simple sequence repeat,SSR)、目标起始密码子多态性(stand codon targeted polymorphism,SCoT)和甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,MSAD技术分别对木薯倍性间的遗传差异、DNA甲基化水平和模式进行分析.结果表明:利用SCoT和SSR均未检测出多态性条带产生,利用MSAP技术可检测出在DNA甲基化水平和模式均发生较大改变.二倍体和同源四倍体的总甲基化率分别为60.21％、59.52％,全甲基化率分别为39.92％、41.42％,半甲基化率分别为20.29％、18.10％.木薯多倍化后,其中有27.30％的位点发生了过甲基化,四倍体有25.00％的位点表现出去甲基化.本研究结果为探究木薯倍性间遗传差异和表观遗传变化规律进行了前期探索.